Senki e Taiju protagonizam a aventura que vai levar a humanidade a reaprender tudo o que já havia aprendido, algo misterioso petrifica todas as pessoas e consequentemente outros seres, mais de mil anos se passam e Senku acorda alguns meses mais tarde Taiju também.
A história vai mostrar como dois jovens um inteligente de mais e outro persistente demais vão refazer os passos da evolução humana para reconstruir o mundo.